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- Diplom-Prüfungsausschüsse (auslaufende Studiengänge)
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- Mathematisches Seminar (Sektion Mathematik)
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- Institut für Experimentelle und Angewandte Physik (Sektion Physik)
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- Institut für Theoretische Physik und Astrophysik (Sektion Physik)
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- Leibniz-Labor für Altersbestimmung und Isotopenforschung
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- Gemeinsame Einrichtungen im Physikzentrum (Sektion Physik)
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- Gemeinsame Einrichtungen im Biologiezentrum (Sektion Biologie)
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- Zell- und Entwicklungsbiologie, AG Bosch
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- Zoologie und Funktionsmorphologie der Vertebraten, AG Böhmer
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- Molekulare Physiologie, AG Roeder
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- Zentrale Einrichtungen im Institut für Geowissenschaften (Sektion Geowissenschaften)
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- Geographisches Institut (Sektion Geographie)
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- Zentrum für Biochemie und Molekularbiologie (BiMo) (selbständige Betriebseinheit)
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- Institut für Ur- und Frühgeschichte (gemeinsame Einrichtung mit der Philosophischen Fakultät) (Sektion Geographie)
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- Forschungs- und Technologiezentrum Westküste (FTZ) Büsum (zentrale Einrichtung)
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- GEOMAR | Helmholtz-Zentrum für Ozeanforschung Kiel (angegliederte Einrichtung)
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- Leibniz-Institut für die Pädagogik der Naturwissenschaften und Mathematik (IPN) (angegliederte Einrichtung)
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- Max-Planck-Institut für Evolutionsbiologie (Kooperationspartner)
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- Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum (Kooperationspartner)
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- Forschungs- und Technologiezentrum Westküste (FTZ)
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- Interdisziplinäres Zentrum Multimedia (IZM) [veralteter Eintrag]
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- Klinik für Hals-, Nasen- und Ohrenheilkunde, Kopf- und Halschirurgie; Klinik für Phoniatrie und Pädaudiologie
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